Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hist2h2beQ64524 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hist2h2beQ64524 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hist2h2beQ64524 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hist2h2beQ64524 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hist2h2beQ64524 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hist2h2beQ64524 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hist2h2beQ64524 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms