Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klf4Q60793 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klf4Q60793 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klf4Q60793 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klf4Q60793 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klf4Q60793 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klf4Q60793 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klf4Q60793 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf4Q60793 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf4Q60793 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klf4Q60793 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klf4Q60793 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klf4Q60793 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klf4Q60793 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klf4Q60793 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klf4Q60793 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klf4Q60793 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf4Q60793 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf4Q60793 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klf4Q60793 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klf4Q60793 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klf4Q60793 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klf4Q60793 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klf4Q60793 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf4Q60793 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf4Q60793 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klf4Q60793 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klf4Q60793 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klf4Q60793 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klf4Q60793 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klf4Q60793 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klf4Q60793 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klf4Q60793 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klf4Q60793 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klf4Q60793 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klf4Q60793 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klf4Q60793 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klf4Q60793 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klf4Q60793 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klf4Q60793 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klf4Q60793 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klf4Q60793 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klf4Q60793 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klf4Q60793 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klf4Q60793 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klf4Q60793 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms