Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HnrnpdQ60668 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HnrnpdQ60668 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HnrnpdQ60668 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HnrnpdQ60668 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HnrnpdQ60668 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HnrnpdQ60668 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HnrnpdQ60668 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HnrnpdQ60668 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HnrnpdQ60668 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HnrnpdQ60668 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HnrnpdQ60668 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HnrnpdQ60668 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HnrnpdQ60668 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HnrnpdQ60668 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HnrnpdQ60668 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HnrnpdQ60668 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HnrnpdQ60668 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HnrnpdQ60668 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HnrnpdQ60668 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HnrnpdQ60668 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HnrnpdQ60668 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HnrnpdQ60668 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HnrnpdQ60668 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HnrnpdQ60668 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HnrnpdQ60668 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HnrnpdQ60668 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HnrnpdQ60668 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HnrnpdQ60668 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HnrnpdQ60668 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HnrnpdQ60668 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HnrnpdQ60668 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HnrnpdQ60668 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HnrnpdQ60668 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HnrnpdQ60668 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HnrnpdQ60668 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HnrnpdQ60668 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HnrnpdQ60668 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HnrnpdQ60668 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms