Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NotoQ5TIS6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NotoQ5TIS6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NotoQ5TIS6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NotoQ5TIS6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NotoQ5TIS6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NotoQ5TIS6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NotoQ5TIS6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NotoQ5TIS6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NotoQ5TIS6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NotoQ5TIS6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NotoQ5TIS6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NotoQ5TIS6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NotoQ5TIS6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NotoQ5TIS6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NotoQ5TIS6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NotoQ5TIS6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NotoQ5TIS6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms