Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bod1Q5SQY2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bod1Q5SQY2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bod1Q5SQY2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bod1Q5SQY2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bod1Q5SQY2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bod1Q5SQY2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bod1Q5SQY2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bod1Q5SQY2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bod1Q5SQY2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bod1Q5SQY2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bod1Q5SQY2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bod1Q5SQY2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bod1Q5SQY2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bod1Q5SQY2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bod1Q5SQY2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bod1Q5SQY2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bod1Q5SQY2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bod1Q5SQY2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bod1Q5SQY2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bod1Q5SQY2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bod1Q5SQY2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bod1Q5SQY2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bod1Q5SQY2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bod1Q5SQY2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bod1Q5SQY2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bod1Q5SQY2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bod1Q5SQY2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms