Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I8

Trav3-1, T cell receptor alpha variable 3-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-1Q5R1I8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trav3-1Q5R1I8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trav3-1Q5R1I8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trav3-1Q5R1I8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trav3-1Q5R1I8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav3-1Q5R1I8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms