Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trdv4Q5R1A3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trdv4Q5R1A3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trdv4Q5R1A3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trdv4Q5R1A3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trdv4Q5R1A3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trdv4Q5R1A3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trdv4Q5R1A3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trdv4Q5R1A3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trdv4Q5R1A3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trdv4Q5R1A3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trdv4Q5R1A3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trdv4Q5R1A3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trdv4Q5R1A3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trdv4Q5R1A3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trdv4Q5R1A3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trdv4Q5R1A3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trdv4Q5R1A3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trdv4Q5R1A3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trdv4Q5R1A3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trdv4Q5R1A3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trdv4Q5R1A3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trdv4Q5R1A3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trdv4Q5R1A3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trdv4Q5R1A3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trdv4Q5R1A3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trdv4Q5R1A3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trdv4Q5R1A3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trdv4Q5R1A3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trdv4Q5R1A3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trdv4Q5R1A3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trdv4Q5R1A3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trdv4Q5R1A3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trdv4Q5R1A3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trdv4Q5R1A3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trdv4Q5R1A3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trdv4Q5R1A3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms