Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RilpQ5ND29 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RilpQ5ND29 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RilpQ5ND29 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RilpQ5ND29 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RilpQ5ND29 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RilpQ5ND29 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RilpQ5ND29 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RilpQ5ND29 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RilpQ5ND29 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RilpQ5ND29 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RilpQ5ND29 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RilpQ5ND29 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RilpQ5ND29 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RilpQ5ND29 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RilpQ5ND29 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RilpQ5ND29 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RilpQ5ND29 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RilpQ5ND29 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RilpQ5ND29 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RilpQ5ND29 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RilpQ5ND29 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RilpQ5ND29 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RilpQ5ND29 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RilpQ5ND29 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RilpQ5ND29 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RilpQ5ND29 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms