Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkaa1Q5EG47 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prkaa1Q5EG47 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prkaa1Q5EG47 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkaa1Q5EG47 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prkaa1Q5EG47 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkaa1Q5EG47 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkaa1Q5EG47 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkaa1Q5EG47 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prkaa1Q5EG47 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prkaa1Q5EG47 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prkaa1Q5EG47 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prkaa1Q5EG47 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prkaa1Q5EG47 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prkaa1Q5EG47 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prkaa1Q5EG47 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prkaa1Q5EG47 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prkaa1Q5EG47 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkaa1Q5EG47 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkaa1Q5EG47 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkaa1Q5EG47 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkaa1Q5EG47 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prkaa1Q5EG47 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkaa1Q5EG47 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkaa1Q5EG47 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkaa1Q5EG47 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkaa1Q5EG47 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prkaa1Q5EG47 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prkaa1Q5EG47 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prkaa1Q5EG47 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkaa1Q5EG47 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Prkaa1Q5EG47 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prkaa1Q5EG47 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkaa1Q5EG47 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkaa1Q5EG47 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkaa1Q5EG47 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkaa1Q5EG47 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkaa1Q5EG47 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkaa1Q5EG47 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkaa1Q5EG47 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkaa1Q5EG47 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prkaa1Q5EG47 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkaa1Q5EG47 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms