Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc8bQ5DU41 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc8bQ5DU41 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc8bQ5DU41 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc8bQ5DU41 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc8bQ5DU41 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc8bQ5DU41 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc8bQ5DU41 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc8bQ5DU41 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc8bQ5DU41 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc8bQ5DU41 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc8bQ5DU41 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc8bQ5DU41 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc8bQ5DU41 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc8bQ5DU41 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc8bQ5DU41 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc8bQ5DU41 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc8bQ5DU41 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc8bQ5DU41 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc8bQ5DU41 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc8bQ5DU41 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc8bQ5DU41 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc8bQ5DU41 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc8bQ5DU41 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc8bQ5DU41 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc8bQ5DU41 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc8bQ5DU41 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc8bQ5DU41 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc8bQ5DU41 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc8bQ5DU41 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc8bQ5DU41 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc8bQ5DU41 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc8bQ5DU41 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc8bQ5DU41 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 484.5 ms