Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WhammQ571B6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WhammQ571B6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
WhammQ571B6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
WhammQ571B6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WhammQ571B6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WhammQ571B6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WhammQ571B6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WhammQ571B6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WhammQ571B6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WhammQ571B6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WhammQ571B6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WhammQ571B6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WhammQ571B6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WhammQ571B6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WhammQ571B6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WhammQ571B6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms