Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm14685Q52KH6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm14685Q52KH6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm14685Q52KH6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm14685Q52KH6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm14685Q52KH6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm14685Q52KH6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm14685Q52KH6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm14685Q52KH6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm14685Q52KH6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm14685Q52KH6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm14685Q52KH6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm14685Q52KH6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm14685Q52KH6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm14685Q52KH6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm14685Q52KH6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm14685Q52KH6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm14685Q52KH6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm14685Q52KH6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm14685Q52KH6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm14685Q52KH6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm14685Q52KH6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm14685Q52KH6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm14685Q52KH6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm14685Q52KH6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms