Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samt2Q497M0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samt2Q497M0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samt2Q497M0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samt2Q497M0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samt2Q497M0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Samt2Q497M0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samt2Q497M0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samt2Q497M0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samt2Q497M0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samt2Q497M0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt2Q497M0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt2Q497M0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samt2Q497M0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samt2Q497M0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samt2Q497M0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samt2Q497M0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samt2Q497M0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samt2Q497M0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samt2Q497M0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samt2Q497M0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samt2Q497M0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samt2Q497M0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samt2Q497M0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samt2Q497M0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samt2Q497M0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samt2Q497M0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms