Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnga4Q3UW12 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga4Q3UW12 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga4Q3UW12 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnga4Q3UW12 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnga4Q3UW12 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnga4Q3UW12 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga4Q3UW12 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnga4Q3UW12 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga4Q3UW12 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga4Q3UW12 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnga4Q3UW12 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga4Q3UW12 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnga4Q3UW12 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnga4Q3UW12 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnga4Q3UW12 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga4Q3UW12 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga4Q3UW12 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga4Q3UW12 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnga4Q3UW12 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnga4Q3UW12 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga4Q3UW12 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnga4Q3UW12 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga4Q3UW12 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga4Q3UW12 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnga4Q3UW12 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnga4Q3UW12 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cnga4Q3UW12 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnga4Q3UW12 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnga4Q3UW12 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnga4Q3UW12 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnga4Q3UW12 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnga4Q3UW12 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga4Q3UW12 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga4Q3UW12 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga4Q3UW12 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnga4Q3UW12 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnga4Q3UW12 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnga4Q3UW12 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnga4Q3UW12 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cnga4Q3UW12 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms