Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slfn4Q3UV66 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slfn4Q3UV66 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn4Q3UV66 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn4Q3UV66 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slfn4Q3UV66 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slfn4Q3UV66 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn4Q3UV66 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slfn4Q3UV66 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slfn4Q3UV66 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slfn4Q3UV66 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slfn4Q3UV66 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slfn4Q3UV66 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slfn4Q3UV66 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn4Q3UV66 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn4Q3UV66 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slfn4Q3UV66 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn4Q3UV66 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slfn4Q3UV66 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slfn4Q3UV66 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slfn4Q3UV66 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn4Q3UV66 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn4Q3UV66 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slfn4Q3UV66 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slfn4Q3UV66 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn4Q3UV66 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn4Q3UV66 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slfn4Q3UV66 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms