Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A530084C06RikQ3UTW2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A530084C06RikQ3UTW2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A530084C06RikQ3UTW2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A530084C06RikQ3UTW2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A530084C06RikQ3UTW2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530084C06RikQ3UTW2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A530084C06RikQ3UTW2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A530084C06RikQ3UTW2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530084C06RikQ3UTW2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A530084C06RikQ3UTW2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530084C06RikQ3UTW2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A530084C06RikQ3UTW2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A530084C06RikQ3UTW2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A530084C06RikQ3UTW2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A530084C06RikQ3UTW2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A530084C06RikQ3UTW2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A530084C06RikQ3UTW2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A530084C06RikQ3UTW2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A530084C06RikQ3UTW2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A530084C06RikQ3UTW2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A530084C06RikQ3UTW2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms