Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm28047Q3US59 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm28047Q3US59 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm28047Q3US59 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm28047Q3US59 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm28047Q3US59 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm28047Q3US59 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm28047Q3US59 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm28047Q3US59 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm28047Q3US59 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm28047Q3US59 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm28047Q3US59 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm28047Q3US59 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm28047Q3US59 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm28047Q3US59 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm28047Q3US59 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm28047Q3US59 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm28047Q3US59 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm28047Q3US59 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm28047Q3US59 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm28047Q3US59 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm28047Q3US59 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gm28047Q3US59 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm28047Q3US59 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm28047Q3US59 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm28047Q3US59 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm28047Q3US59 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm28047Q3US59 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gm28047Q3US59 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm28047Q3US59 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Gm28047Q3US59 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm28047Q3US59 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm28047Q3US59 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm28047Q3US59 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gm28047Q3US59 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gm28047Q3US59 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gm28047Q3US59 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm28047Q3US59 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm28047Q3US59 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm28047Q3US59 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm28047Q3US59 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm28047Q3US59 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gm28047Q3US59 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gm28047Q3US59 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gm28047Q3US59 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gm28047Q3US59 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gm28047Q3US59 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm28047Q3US59 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm28047Q3US59 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm28047Q3US59 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm28047Q3US59 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm28047Q3US59 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm28047Q3US59 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gm28047Q3US59 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm28047Q3US59 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms