Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ41

Tmprss11a, Transmembrane protease serine 11A, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11aQ3UQ41 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmprss11aQ3UQ41 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmprss11aQ3UQ41 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmprss11aQ3UQ41 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmprss11aQ3UQ41 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmprss11aQ3UQ41 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmprss11aQ3UQ41 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmprss11aQ3UQ41 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmprss11aQ3UQ41 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmprss11aQ3UQ41 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss11aQ3UQ41 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss11aQ3UQ41 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss11aQ3UQ41 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmprss11aQ3UQ41 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmprss11aQ3UQ41 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmprss11aQ3UQ41 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmprss11aQ3UQ41 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmprss11aQ3UQ41 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmprss11aQ3UQ41 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmprss11aQ3UQ41 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmprss11aQ3UQ41 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmprss11aQ3UQ41 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmprss11aQ3UQ41 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmprss11aQ3UQ41 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmprss11aQ3UQ41 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmprss11aQ3UQ41 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmprss11aQ3UQ41 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss11aQ3UQ41 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss11aQ3UQ41 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss11aQ3UQ41 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmprss11aQ3UQ41 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmprss11aQ3UQ41 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmprss11aQ3UQ41 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss11aQ3UQ41 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss11aQ3UQ41 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmprss11aQ3UQ41 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmprss11aQ3UQ41 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmprss11aQ3UQ41 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmprss11aQ3UQ41 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmprss11aQ3UQ41 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmprss11aQ3UQ41 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmprss11aQ3UQ41 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmprss11aQ3UQ41 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmprss11aQ3UQ41 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmprss11aQ3UQ41 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmprss11aQ3UQ41 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmprss11aQ3UQ41 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmprss11aQ3UQ41 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmprss11aQ3UQ41 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmprss11aQ3UQ41 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmprss11aQ3UQ41 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmprss11aQ3UQ41 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmprss11aQ3UQ41 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmprss11aQ3UQ41 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmprss11aQ3UQ41 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmprss11aQ3UQ41 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmprss11aQ3UQ41 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmprss11aQ3UQ41 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmprss11aQ3UQ41 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmprss11aQ3UQ41 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmprss11aQ3UQ41 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmprss11aQ3UQ41 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms