Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem253Q3UNB8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem253Q3UNB8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem253Q3UNB8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem253Q3UNB8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem253Q3UNB8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem253Q3UNB8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem253Q3UNB8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem253Q3UNB8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem253Q3UNB8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem253Q3UNB8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem253Q3UNB8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem253Q3UNB8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem253Q3UNB8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem253Q3UNB8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem253Q3UNB8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem253Q3UNB8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem253Q3UNB8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem253Q3UNB8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem253Q3UNB8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem253Q3UNB8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem253Q3UNB8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem253Q3UNB8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem253Q3UNB8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem253Q3UNB8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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