Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpr55Q3UJF0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gpr55Q3UJF0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gpr55Q3UJF0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpr55Q3UJF0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpr55Q3UJF0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpr55Q3UJF0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpr55Q3UJF0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpr55Q3UJF0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpr55Q3UJF0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpr55Q3UJF0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpr55Q3UJF0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpr55Q3UJF0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpr55Q3UJF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpr55Q3UJF0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpr55Q3UJF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms