Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf149Q3U2C5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf149Q3U2C5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf149Q3U2C5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf149Q3U2C5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf149Q3U2C5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf149Q3U2C5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf149Q3U2C5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf149Q3U2C5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf149Q3U2C5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf149Q3U2C5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf149Q3U2C5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf149Q3U2C5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf149Q3U2C5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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