Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUD9

Tmem18, Transmembrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem18Q3TUD9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem18Q3TUD9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem18Q3TUD9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tmem18Q3TUD9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem18Q3TUD9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem18Q3TUD9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem18Q3TUD9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem18Q3TUD9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem18Q3TUD9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem18Q3TUD9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem18Q3TUD9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem18Q3TUD9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem18Q3TUD9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem18Q3TUD9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem18Q3TUD9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem18Q3TUD9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tmem18Q3TUD9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem18Q3TUD9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem18Q3TUD9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem18Q3TUD9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem18Q3TUD9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem18Q3TUD9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem18Q3TUD9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem18Q3TUD9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem18Q3TUD9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem18Q3TUD9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms