Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc102aQ3TMW1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc102aQ3TMW1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc102aQ3TMW1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc102aQ3TMW1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc102aQ3TMW1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc102aQ3TMW1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc102aQ3TMW1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc102aQ3TMW1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc102aQ3TMW1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc102aQ3TMW1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc102aQ3TMW1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc102aQ3TMW1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc102aQ3TMW1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc102aQ3TMW1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc102aQ3TMW1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc102aQ3TMW1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc102aQ3TMW1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc102aQ3TMW1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc102aQ3TMW1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc102aQ3TMW1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc102aQ3TMW1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc102aQ3TMW1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc102aQ3TMW1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc102aQ3TMW1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc102aQ3TMW1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc102aQ3TMW1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc102aQ3TMW1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc102aQ3TMW1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc102aQ3TMW1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc102aQ3TMW1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc102aQ3TMW1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc102aQ3TMW1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc102aQ3TMW1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc102aQ3TMW1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc102aQ3TMW1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc102aQ3TMW1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc102aQ3TMW1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc102aQ3TMW1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc102aQ3TMW1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc102aQ3TMW1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc102aQ3TMW1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms