Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2afvQ3THW5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H2afvQ3THW5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H2afvQ3THW5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
H2afvQ3THW5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H2afvQ3THW5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2afvQ3THW5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2afvQ3THW5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2afvQ3THW5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2afvQ3THW5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
H2afvQ3THW5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H2afvQ3THW5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
H2afvQ3THW5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H2afvQ3THW5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2afvQ3THW5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
H2afvQ3THW5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H2afvQ3THW5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
H2afvQ3THW5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H2afvQ3THW5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H2afvQ3THW5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H2afvQ3THW5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2afvQ3THW5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2afvQ3THW5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2afvQ3THW5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H2afvQ3THW5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2afvQ3THW5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2afvQ3THW5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H2afvQ3THW5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2afvQ3THW5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H2afvQ3THW5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H2afvQ3THW5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
H2afvQ3THW5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
H2afvQ3THW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H2afvQ3THW5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H2afvQ3THW5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H2afvQ3THW5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2afvQ3THW5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2afvQ3THW5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2afvQ3THW5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2afvQ3THW5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2afvQ3THW5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2afvQ3THW5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2afvQ3THW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2afvQ3THW5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms