Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEI4

Uncharacterized protein C15orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TEI4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TEI4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TEI4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TEI4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TEI4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TEI4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TEI4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TEI4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TEI4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TEI4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TEI4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TEI4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TEI4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TEI4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TEI4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q3TEI4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TEI4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TEI4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TEI4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3TEI4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TEI4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TEI4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TEI4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TEI4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TEI4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TEI4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TEI4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TEI4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TEI4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TEI4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TEI4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TEI4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3TEI4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3TEI4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q3TEI4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3TEI4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q3TEI4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q3TEI4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q3TEI4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q3TEI4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q3TEI4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q3TEI4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q3TEI4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TEI4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q3TEI4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms