Protein–RNA interactions for Protein: Q18PI6

Cd84, SLAM family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd84Q18PI6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd84Q18PI6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd84Q18PI6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cd84Q18PI6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd84Q18PI6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd84Q18PI6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms