Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd3Q14AI6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rpusd3Q14AI6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rpusd3Q14AI6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd3Q14AI6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpusd3Q14AI6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd3Q14AI6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms