Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc138Q0VF22 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc138Q0VF22 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc138Q0VF22 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc138Q0VF22 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc138Q0VF22 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc138Q0VF22 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc138Q0VF22 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc138Q0VF22 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc138Q0VF22 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc138Q0VF22 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc138Q0VF22 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc138Q0VF22 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc138Q0VF22 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc138Q0VF22 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc138Q0VF22 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc138Q0VF22 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc138Q0VF22 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc138Q0VF22 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc138Q0VF22 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc138Q0VF22 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc138Q0VF22 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc138Q0VF22 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms