Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NeblQ0II04 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NeblQ0II04 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NeblQ0II04 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NeblQ0II04 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NeblQ0II04 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NeblQ0II04 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NeblQ0II04 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NeblQ0II04 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NeblQ0II04 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NeblQ0II04 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NeblQ0II04 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NeblQ0II04 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NeblQ0II04 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NeblQ0II04 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NeblQ0II04 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NeblQ0II04 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NeblQ0II04 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NeblQ0II04 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NeblQ0II04 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NeblQ0II04 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NeblQ0II04 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NeblQ0II04 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NeblQ0II04 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NeblQ0II04 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NeblQ0II04 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NeblQ0II04 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NeblQ0II04 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NeblQ0II04 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NeblQ0II04 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NeblQ0II04 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NeblQ0II04 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NeblQ0II04 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NeblQ0II04 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NeblQ0II04 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NeblQ0II04 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NeblQ0II04 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NeblQ0II04 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NeblQ0II04 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NeblQ0II04 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NeblQ0II04 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NeblQ0II04 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NeblQ0II04 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NeblQ0II04 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NeblQ0II04 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NeblQ0II04 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NeblQ0II04 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NeblQ0II04 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NeblQ0II04 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NeblQ0II04 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NeblQ0II04 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NeblQ0II04 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NeblQ0II04 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NeblQ0II04 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NeblQ0II04 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeblQ0II04 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeblQ0II04 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeblQ0II04 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeblQ0II04 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NeblQ0II04 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeblQ0II04 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NeblQ0II04 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NeblQ0II04 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NeblQ0II04 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NeblQ0II04 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NeblQ0II04 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeblQ0II04 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeblQ0II04 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeblQ0II04 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NeblQ0II04 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms