Protein–RNA interactions for Protein: Q0EEE2

Ptchd3, Patched domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptchd3Q0EEE2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptchd3Q0EEE2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptchd3Q0EEE2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptchd3Q0EEE2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptchd3Q0EEE2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptchd3Q0EEE2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptchd3Q0EEE2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptchd3Q0EEE2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptchd3Q0EEE2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptchd3Q0EEE2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptchd3Q0EEE2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptchd3Q0EEE2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptchd3Q0EEE2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptchd3Q0EEE2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptchd3Q0EEE2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptchd3Q0EEE2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptchd3Q0EEE2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptchd3Q0EEE2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptchd3Q0EEE2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms