Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdf3Q07104 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdf3Q07104 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf3Q07104 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf3Q07104 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf3Q07104 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gdf3Q07104 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf3Q07104 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms