Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Emx1Q04742 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Emx1Q04742 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Emx1Q04742 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Emx1Q04742 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Emx1Q04742 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Emx1Q04742 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Emx1Q04742 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Emx1Q04742 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Emx1Q04742 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emx1Q04742 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Emx1Q04742 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Emx1Q04742 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Emx1Q04742 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Emx1Q04742 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Emx1Q04742 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Emx1Q04742 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Emx1Q04742 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emx1Q04742 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emx1Q04742 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emx1Q04742 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Emx1Q04742 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Emx1Q04742 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Emx1Q04742 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emx1Q04742 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Emx1Q04742 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Emx1Q04742 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emx1Q04742 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emx1Q04742 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emx1Q04742 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emx1Q04742 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emx1Q04742 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emx1Q04742 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emx1Q04742 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Emx1Q04742 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emx1Q04742 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emx1Q04742 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emx1Q04742 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Emx1Q04742 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms