Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarcad1Q04692 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarcad1Q04692 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarcad1Q04692 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarcad1Q04692 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarcad1Q04692 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarcad1Q04692 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarcad1Q04692 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarcad1Q04692 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarcad1Q04692 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarcad1Q04692 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarcad1Q04692 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarcad1Q04692 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarcad1Q04692 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarcad1Q04692 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarcad1Q04692 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarcad1Q04692 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarcad1Q04692 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarcad1Q04692 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcad1Q04692 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcad1Q04692 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcad1Q04692 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarcad1Q04692 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarcad1Q04692 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarcad1Q04692 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarcad1Q04692 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarcad1Q04692 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarcad1Q04692 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarcad1Q04692 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarcad1Q04692 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarcad1Q04692 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarcad1Q04692 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarcad1Q04692 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarcad1Q04692 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcad1Q04692 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcad1Q04692 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcad1Q04692 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarcad1Q04692 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcad1Q04692 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcad1Q04692 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcad1Q04692 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarcad1Q04692 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarcad1Q04692 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcad1Q04692 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcad1Q04692 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcad1Q04692 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcad1Q04692 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms