Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pfdn6Q03958 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pfdn6Q03958 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pfdn6Q03958 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pfdn6Q03958 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pfdn6Q03958 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pfdn6Q03958 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pfdn6Q03958 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pfdn6Q03958 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pfdn6Q03958 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pfdn6Q03958 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pfdn6Q03958 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pfdn6Q03958 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pfdn6Q03958 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pfdn6Q03958 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pfdn6Q03958 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pfdn6Q03958 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pfdn6Q03958 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pfdn6Q03958 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pfdn6Q03958 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pfdn6Q03958 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pfdn6Q03958 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pfdn6Q03958 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pfdn6Q03958 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pfdn6Q03958 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pfdn6Q03958 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pfdn6Q03958 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pfdn6Q03958 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pfdn6Q03958 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pfdn6Q03958 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pfdn6Q03958 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pfdn6Q03958 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pfdn6Q03958 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pfdn6Q03958 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pfdn6Q03958 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pfdn6Q03958 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pfdn6Q03958 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pfdn6Q03958 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms