Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HmmrQ00547 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HmmrQ00547 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HmmrQ00547 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HmmrQ00547 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HmmrQ00547 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HmmrQ00547 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HmmrQ00547 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HmmrQ00547 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HmmrQ00547 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HmmrQ00547 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HmmrQ00547 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HmmrQ00547 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HmmrQ00547 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HmmrQ00547 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HmmrQ00547 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms