Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Meis3P97368 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Meis3P97368 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Meis3P97368 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Meis3P97368 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Meis3P97368 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Meis3P97368 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Meis3P97368 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Meis3P97368 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Meis3P97368 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Meis3P97368 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Meis3P97368 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Meis3P97368 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Meis3P97368 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Meis3P97368 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Meis3P97368 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Meis3P97368 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Meis3P97368 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Meis3P97368 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Meis3P97368 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Meis3P97368 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Meis3P97368 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Meis3P97368 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Meis3P97368 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Meis3P97368 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Meis3P97368 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Meis3P97368 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Meis3P97368 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Meis3P97368 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Meis3P97368 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Meis3P97368 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Meis3P97368 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Meis3P97368 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Meis3P97368 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Meis3P97368 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Meis3P97368 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Meis3P97368 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Meis3P97368 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Meis3P97368 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Meis3P97368 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Meis3P97368 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Meis3P97368 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Meis3P97368 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Meis3P97368 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Meis3P97368 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Meis3P97368 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Meis3P97368 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Meis3P97368 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Meis3P97368 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Meis3P97368 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Meis3P97368 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Meis3P97368 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Meis3P97368 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Meis3P97368 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Meis3P97368 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms