Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Taf1aP97357 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf1aP97357 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf1aP97357 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf1aP97357 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1aP97357 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1aP97357 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1aP97357 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf1aP97357 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf1aP97357 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1aP97357 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf1aP97357 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf1aP97357 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf1aP97357 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf1aP97357 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1aP97357 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf1aP97357 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf1aP97357 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf1aP97357 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1aP97357 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf1aP97357 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf1aP97357 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1aP97357 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf1aP97357 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf1aP97357 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf1aP97357 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf1aP97357 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms