Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps3aP97351 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps3aP97351 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps3aP97351 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps3aP97351 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps3aP97351 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps3aP97351 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps3aP97351 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps3aP97351 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps3aP97351 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps3aP97351 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps3aP97351 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps3aP97351 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps3aP97351 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps3aP97351 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps3aP97351 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps3aP97351 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps3aP97351 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps3aP97351 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps3aP97351 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps3aP97351 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps3aP97351 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps3aP97351 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps3aP97351 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps3aP97351 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rps3aP97351 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps3aP97351 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps3aP97351 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps3aP97351 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps3aP97351 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps3aP97351 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps3aP97351 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps3aP97351 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps3aP97351 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps3aP97351 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps3aP97351 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps3aP97351 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps3aP97351 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms