Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx1P81068 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx1P81068 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx1P81068 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx1P81068 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx1P81068 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx1P81068 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx1P81068 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx1P81068 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx1P81068 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx1P81068 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx1P81068 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx1P81068 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx1P81068 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx1P81068 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx1P81068 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx1P81068 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx1P81068 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx1P81068 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx1P81068 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx1P81068 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx1P81068 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx1P81068 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx1P81068 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx1P81068 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx1P81068 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx1P81068 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx1P81068 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx1P81068 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irx1P81068 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irx1P81068 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx1P81068 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx1P81068 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx1P81068 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx1P81068 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx1P81068 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx1P81068 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx1P81068 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx1P81068 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx1P81068 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx1P81068 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms