Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx4P70452 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx4P70452 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx4P70452 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx4P70452 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx4P70452 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx4P70452 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx4P70452 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx4P70452 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx4P70452 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx4P70452 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx4P70452 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx4P70452 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx4P70452 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx4P70452 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx4P70452 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx4P70452 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Stx4P70452 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx4P70452 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx4P70452 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx4P70452 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx4P70452 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx4P70452 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx4P70452 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx4P70452 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx4P70452 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx4P70452 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx4P70452 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx4P70452 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx4P70452 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx4P70452 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stx4P70452 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx4P70452 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stx4P70452 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stx4P70452 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stx4P70452 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx4P70452 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx4P70452 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx4P70452 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx4P70452 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Stx4P70452 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Stx4P70452 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx4P70452 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx4P70452 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stx4P70452 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms