Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ufd1P70362 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ufd1P70362 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ufd1P70362 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufd1P70362 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ufd1P70362 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ufd1P70362 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms