Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp3P70281 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sycp3P70281 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp3P70281 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp3P70281 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp3P70281 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sycp3P70281 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sycp3P70281 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sycp3P70281 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sycp3P70281 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sycp3P70281 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sycp3P70281 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sycp3P70281 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sycp3P70281 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sycp3P70281 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sycp3P70281 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sycp3P70281 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sycp3P70281 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sycp3P70281 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sycp3P70281 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sycp3P70281 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sycp3P70281 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sycp3P70281 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sycp3P70281 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sycp3P70281 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Sycp3P70281 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sycp3P70281 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sycp3P70281 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sycp3P70281 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sycp3P70281 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sycp3P70281 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sycp3P70281 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sycp3P70281 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sycp3P70281 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sycp3P70281 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms