Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Stra8P70278 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Stra8P70278 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Stra8P70278 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Stra8P70278 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Stra8P70278 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Stra8P70278 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Stra8P70278 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Stra8P70278 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Stra8P70278 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Stra8P70278 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Stra8P70278 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Stra8P70278 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Stra8P70278 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Stra8P70278 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Stra8P70278 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Stra8P70278 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Stra8P70278 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Stra8P70278 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Stra8P70278 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Stra8P70278 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Stra8P70278 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Stra8P70278 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Stra8P70278 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Stra8P70278 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Stra8P70278 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Stra8P70278 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Stra8P70278 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Stra8P70278 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Stra8P70278 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Stra8P70278 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Stra8P70278 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Stra8P70278 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Stra8P70278 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Stra8P70278 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Stra8P70278 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Stra8P70278 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Stra8P70278 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Stra8P70278 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Stra8P70278 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Stra8P70278 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Stra8P70278 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Stra8P70278 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Stra8P70278 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Stra8P70278 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Stra8P70278 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Stra8P70278 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Stra8P70278 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Stra8P70278 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Stra8P70278 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Stra8P70278 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Stra8P70278 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Stra8P70278 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Stra8P70278 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Stra8P70278 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Stra8P70278 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Stra8P70278 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Stra8P70278 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Stra8P70278 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Stra8P70278 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Stra8P70278 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Stra8P70278 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Stra8P70278 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Stra8P70278 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Stra8P70278 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Stra8P70278 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Stra8P70278 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Stra8P70278 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Stra8P70278 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Stra8P70278 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Stra8P70278 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Stra8P70278 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Stra8P70278 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Stra8P70278 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Stra8P70278 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms