Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Traf6P70196 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Traf6P70196 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf6P70196 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Traf6P70196 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf6P70196 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf6P70196 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Traf6P70196 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf6P70196 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf6P70196 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf6P70196 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Traf6P70196 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf6P70196 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Traf6P70196 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf6P70196 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Traf6P70196 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Traf6P70196 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf6P70196 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Traf6P70196 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf6P70196 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf6P70196 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Traf6P70196 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf6P70196 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf6P70196 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf6P70196 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf6P70196 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf6P70196 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf6P70196 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf6P70196 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf6P70196 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf6P70196 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Traf6P70196 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf6P70196 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf6P70196 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Traf6P70196 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf6P70196 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf6P70196 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf6P70196 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.7 ms