Protein–RNA interactions for Protein: P68373

Tuba1c, Tubulin alpha-1C chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba1cP68373 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tuba1cP68373 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tuba1cP68373 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tuba1cP68373 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tuba1cP68373 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tuba1cP68373 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tuba1cP68373 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tuba1cP68373 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tuba1cP68373 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tuba1cP68373 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tuba1cP68373 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tuba1cP68373 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tuba1cP68373 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tuba1cP68373 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tuba1cP68373 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tuba1cP68373 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms