Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tubb4bP68372 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tubb4bP68372 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb4bP68372 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubb4bP68372 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tubb4bP68372 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Tubb4bP68372 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb4bP68372 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb4bP68372 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb4bP68372 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb4bP68372 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb4bP68372 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb4bP68372 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb4bP68372 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb4bP68372 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubb4bP68372 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb4bP68372 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb4bP68372 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tubb4bP68372 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb4bP68372 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb4bP68372 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb4bP68372 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb4bP68372 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb4bP68372 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tubb4bP68372 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubb4bP68372 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubb4bP68372 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubb4bP68372 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubb4bP68372 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubb4bP68372 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubb4bP68372 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubb4bP68372 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tubb4bP68372 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb4bP68372 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb4bP68372 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubb4bP68372 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubb4bP68372 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubb4bP68372 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubb4bP68372 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb4bP68372 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb4bP68372 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb4bP68372 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubb4bP68372 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tubb4bP68372 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubb4bP68372 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubb4bP68372 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubb4bP68372 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubb4bP68372 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubb4bP68372 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms