Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gabrb3P63080 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gabrb3P63080 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabrb3P63080 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabrb3P63080 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabrb3P63080 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabrb3P63080 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gabrb3P63080 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabrb3P63080 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gabrb3P63080 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabrb3P63080 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gabrb3P63080 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gabrb3P63080 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gabrb3P63080 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gabrb3P63080 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabrb3P63080 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabrb3P63080 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabrb3P63080 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabrb3P63080 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabrb3P63080 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gabrb3P63080 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabrb3P63080 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabrb3P63080 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabrb3P63080 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabrb3P63080 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabrb3P63080 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms