Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl30P62889 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl30P62889 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl30P62889 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl30P62889 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl30P62889 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl30P62889 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl30P62889 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl30P62889 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl30P62889 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl30P62889 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl30P62889 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl30P62889 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl30P62889 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl30P62889 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl30P62889 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl30P62889 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl30P62889 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl30P62889 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms