Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl23aP62751 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl23aP62751 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl23aP62751 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl23aP62751 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl23aP62751 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl23aP62751 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl23aP62751 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms