Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps4xP62702 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps4xP62702 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps4xP62702 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps4xP62702 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps4xP62702 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps4xP62702 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps4xP62702 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps4xP62702 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps4xP62702 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps4xP62702 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps4xP62702 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps4xP62702 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps4xP62702 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps4xP62702 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps4xP62702 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps4xP62702 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rps4xP62702 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps4xP62702 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps4xP62702 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps4xP62702 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps4xP62702 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps4xP62702 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps4xP62702 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps4xP62702 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps4xP62702 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps4xP62702 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps4xP62702 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps4xP62702 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256 ms